天科股份的自查报告在董事会审议时，遭到三名董事质疑，认为自查报告中存在与事实严重不符的内容。
　　天科股份的自查报告称，自2007年2月调整董事长人选开始，公司的董事会一直存在分歧，由于公司大股东之间持股比例相差甚微，第一大股东没有绝对的话语权，大股东之间也没有良好的沟通，所以董事会没有在公司运作和发展上达成高度一致，同时监事会和董事会也存在对立现象。而且，尽管形式上公司与第一大股东实行了三分开，但公司的党委、工会都是和第一大股东融合在一起的，报告称，第一大股东对公司的影响是无形的，也是巨大的。
　　天科股份的自查报告和整改计划在2007年6月7日召开的董事会会议审议时，虽以6票赞成获得了通过，但有3票反对，即遭到了三名董事的反对。
　　三名持反对意见的董事认为，自查报告中存在与事实严重不符的内容；公司存在的根本问题是实际控制人控制董事会影响公司正常经营和战略发展。
　　他们认为，大股东西南化工研究设计院持公司23.13%股份，已不是公司控股股东也不是实际控制人，其在公司股东会股权比例、董事会及核心管理岗位的人数比例上均无控制能力。因为第二、三、四大股东成都愿景科技有限公司、成都美辰科技有限责任公司、沈阳易捷电子机械有限公司合并持有公司24.51%股份，其推荐的董事在罢免并更换董事长、年报等董事会重大决议中高度一致。
　　三名董事表示，此自查报告未找准公司目前存在的主要问题，公司至今未制定战略发展规划，发展已受到严重影响。